产品说明:
Diagenode标记缓冲液(2x)是进行任何标记反应的推荐试剂。它可以与DNA或染色质样品上的Diagenodetagmentase结合使用,作为总体积反应的一半。这是ATAC-seq实验中使用的试剂。
储存条件:储存在-20°C。
预防 措施:本产品仅供研究使用。不适用于诊断或治疗程序。
使用示例 :Diagenode标记缓冲区(2x)可用于执行以下协议中的标记步骤。
碎裂测定实验:
可以在λDNA上进行片段化测定,使用以下孵育混合物进行1次反应:
然后将反应物在55°C下孵育7分钟
可以通过加入SDS溶液(0.2%最终)在室温下孵育5分钟来停止标记
然后可以在琼脂糖凝胶上分析DNA
ATAC-seq实验:
细胞裂解和细胞核分离后,细胞核沉淀可以与以下混合物一起孵育进行 1 次反应
每个反应的细胞核数量将取决于ATAC-seq实验设计。使用所提出的方案在每个反应的50,000个细胞核上成功标记。
然后将反应物在37°C下孵育30分钟。
然后可以通过从Diagenode MicroChIP透视柱(货号C03040001)中加入250μlDNA结合缓冲液来停止标记反应。
然后可以使用MicroChIP透视柱(货号C03040001)纯化标记文库,并进行扩增
Diagenode标记缓冲液(2x)是进行任何标记反应的推荐试剂。它可以与DNA或染色质样品上的Diagenodetagmentase结合使用,作为总体积反应的一半。这是ATAC-seq实验中使用的试剂。
储存条件:储存在-20°C。
预防 措施:本产品仅供研究使用。不适用于诊断或治疗程序。
使用示例 :Diagenode标记缓冲区(2x)可用于执行以下协议中的标记步骤。
碎裂测定实验:
可以在λDNA上进行片段化测定,使用以下孵育混合物进行1次反应:
标记缓冲区(2个) | 10µl |
λDNA(50纳克/µl) | 2µl |
标记酶负载 | 1µl |
不含核酸酶的水 | 7µl |
可以通过加入SDS溶液(0.2%最终)在室温下孵育5分钟来停止标记
然后可以在琼脂糖凝胶上分析DNA
ATAC-seq实验:
细胞裂解和细胞核分离后,细胞核沉淀可以与以下混合物一起孵育进行 1 次反应
标记缓冲区(2个) | 25 µl |
已加载标记酶 | 2.5 µl |
Digitonin 1% | 0.5 µl |
Tween20 10% | 0.5 µl |
PBS | 16.5 µl |
不含核酸酶的水 | 5 µl |
Nuclei颗粒* |
然后将反应物在37°C下孵育30分钟。
然后可以通过从Diagenode MicroChIP透视柱(货号C03040001)中加入250μlDNA结合缓冲液来停止标记反应。
然后可以使用MicroChIP透视柱(货号C03040001)纯化标记文库,并进行扩增