Script III 1st Strand cDNA Synthesis Kit(With dsDNase)(for PCR or qPCR)
目录号:71118
产品内容
Components |
71118-50 50 rxns (20 μl/rxn) |
71118-100 100 rxns (20 μl/rxn) |
5x TRUE Reaction Mix |
200 μl |
400 μl |
dsDNase |
50 μl |
100 μl |
Oligo(dT)18 (0.5 μg /μl) |
50 μl |
100 μl |
Random primer (N6) |
50 μl |
100 μ |
RNase free H2O |
1.5 m |
1.5 ml |
保存条件:-20℃保存,有效期 12 个月。
产品简介
Script III 1st Strand cDNA Synthesis Kit(With dsDNase)采用第三代高效逆转录酶,具有更强的延伸能力和稳定性,并配备了具有DNA分解活性的特殊dsDNase,只需一步操作, 即可同时完成基因组清除与逆转录反应,操作方便快捷,可用于长达12kb的cDNA合成以及高比例的全长cDNA文库的构建等。逆转录产物可以用于PCR,克隆基因;也可以用于qPCR,兼容染料法和探针法,用来检测高拷贝或低拷贝基因。
Oligo(dT)18 和Random primer (N6)是独立组分,可以自由选用,以获得最佳的逆转录结果!
引物的选择:
1. 如果RNA模板来源于真核生物,首选Oligo (dT),与真核生物mRNA的3’PolyA尾配对,可获得最高产量的全长cDNA。
2. 如果对一些物种,不能确定mRNA是否有polyA尾的情况下,首选Oligo(dT),不成功再尝试基因特异性引物(GSP)和Random primer为引物。
3. 基因特异性引物(GSP)的特异性最高。但有些情况下,用于PCR反应的GSP无法有效引导第一链cDNA合成,可改用Oligo (dT)或Randomprimer重新进行逆转录。
4. Random primer特异性最低,所有RNA,包括mRNA,rRNA,tRNA均可以作为Random primer的模板。当目标区域具有复杂二级结构或GC含量较高,或者模板为原核生物来源,使用Oligo (dT)或基因特异性引物(GSP)无法有效引导cDNA合成时,可使用Random primer为引物。
5. 如果合成cDNA下游用于qPCR,可将Oligo (dT)与Random primer混合使用(各加1μl /20μl反应体系),可使mRNA的各个区域cDNA合成效率相同,有助于提高qPCR结果的真实性和重复性。
第一连 cDNA 合成 (以 20 μl 反应体系为例)
1. 反应体系的配制
操作前,请将各组分轻弹混匀,点甩离心收集至管底,置冰上备用。
使用 RNase-Free PCR 管在冰上配制:
Components |
Volume |
Total RNA |
50 ng - 5 μg |
Oligo(dT)18 (0.5 μg /μl) or Random primer (N6) (0.1 μg/μl) or GSP (Gene Specific Primer , 2 pmol/μl) or |
1 μl |
1 μl |
|
1 μl |
|
5x TRUE Reaction Mix |
4 μl |
dsDNase |
1 μl |
RNase free H2O |
To 20 μl |
2.轻柔吸打混匀,点甩离心,置 PCR 仪进行逆转录反应。
如用Oligo(dT)18或基因特异性引物(GSP),产物用于PCR:42℃孵育30 min;产物用于qPCR:42℃孵育15 min。
如用 Random Primer,25℃孵育10 min 后,产物用于 PCR,42℃孵育30 min;25℃孵育 10 min 后,产物用于 qPCR,42℃孵育 15 min。
注意:如果模板具有复杂二级结构或高 GC 区域,可以先只加 RNA 模板、 引物和 RNase free H2O,混匀,65℃变性 5 min,冰上冷却,点甩离心后加入其它成分,并将 42℃孵育温度提升至 50°C,有助于提高产量。
3. 85°C加热 5 sec,失活RTase和dsDNase,终止反应。
逆转录产物可立即用于PCR或qPCR反应,或保存于-20°C,并在半年内使用;长期存放建议分装后在-70°C保存,cDNA应避免反复冻融。
PCR
建议取2 - 4 μl的cDNA产物原液作为PCR模板。
1. 常规扩增:71019-2x Taq PCR MasterMix (30sec/kb)
71800-2x Lightning Taq PCR MasterMix (10sec/kb)
2. 高保真扩增:71812-2x FastHiFi PCR MasterMix (≤3kb片段)
71814-2×LongHiFi PCR MasterMix (≤10kb片段)
qPCR
建议取1~2μl cDNA产物原液作为20μl qPCR反应体系的模板。如果基因表达量较高,请根据实际情况适当稀释cDNA模板后使用。
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